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上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司现有股东：上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中国科学院上海营养与健康研究所、中国科学院上海微系统与信息技术研究所、复旦大学、上海交通大学、上海仪电（集团）有限公司、上海交通大学医学院附属瑞金医院和上海博星基因芯片有限公司。2003年2月，国家发展与改革委员会批准上海生物芯片有限公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”项目并正式命名，项目总投资2.9亿元人民币。公司（中心）位于上海浦东张江高科技园区生物医药产业基地，总占地4万平方米，建筑面积2万多平方米，现有员工300余人。

根据国家发展与改革委员会对“生物芯片上海国家工程研究中心”项目的建设任务要求和公司发展战略，公司化国家工程研究中心致力于生物芯片在生命科学研究、医疗保健和药物开发等领域的应用和推广。通过十余年的建设和发展，确立了以生物样本资源库、组织芯片、基因表达谱芯片和测序等为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学诊断技术和产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子医学检验服务和分子诊断产品研发生产销售三大主营业务。公司（中心）已经步入了科研与合作、产品研发生产销售和技术服务以及开展国际合作和人才交流培养等良性发展轨道，具备了自主创新、市场竞争、为行业服务贡献的能力。

公司（中心）本着“科研创新、市场导向、以人为本”的价值理念，按照国家工程研究中心的建设目标要求，努力使公司形成集技术创新、成果转化、综合服务、人才培养于一体，具有国际先进水平的国家生物芯片产业化基地；把公司建设成为具有国际先进水平和自主研发能力的行业标杆性科技创新型企业，为上海加快成为具有全球影响力的科技创新中心目标，为我国生物医药领域科技创新和产业化做出贡献。